Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf2P39429 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf2P39429 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms