Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtlP38585 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtlP38585 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtlP38585 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtlP38585 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtlP38585 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms