Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sar1aP36536 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms