Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LdlrP35951 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LdlrP35951 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LdlrP35951 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms