Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms