Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rfc1P35601 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rfc1P35601 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms