Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpardP35396 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpardP35396 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpardP35396 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpardP35396 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms