Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab17P35292 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab17P35292 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms