Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab23P35288 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab23P35288 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab23P35288 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms