Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Usp4P35123 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp4P35123 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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