Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc5P32043 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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