Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa10P31310 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms