Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc10P31257 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms