Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tacr1P30548 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tacr1P30548 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tacr1P30548 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tacr1P30548 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tacr1P30548 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tacr1P30548 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tacr1P30548 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tacr1P30548 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tacr1P30548 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tacr1P30548 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tacr1P30548 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tacr1P30548 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tacr1P30548 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tacr1P30548 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms