Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col2a1P28481 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col2a1P28481 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms