Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defa3P28310 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms