Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa2P28309 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms