Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja4P28235 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja4P28235 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms