Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb9P28076 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms