Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpbP27790 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpbP27790 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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