Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ChgaP26339 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms