Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NdnP25233 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NdnP25233 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NdnP25233 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NdnP25233 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NdnP25233 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NdnP25233 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NdnP25233 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NdnP25233 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NdnP25233 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NdnP25233 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NdnP25233 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NdnP25233 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NdnP25233 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NdnP25233 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NdnP25233 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NdnP25233 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
NdnP25233 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NdnP25233 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NdnP25233 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NdnP25233 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NdnP25233 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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NdnP25233 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NdnP25233 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NdnP25233 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NdnP25233 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NdnP25233 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NdnP25233 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NdnP25233 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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