Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc2P20801 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms