Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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