Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms