Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP20293 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP20293 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP20293 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TP20293 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TP20293 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TP20293 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP20293 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP20293 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP20293 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP20293 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP20293 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP20293 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP20293 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP20293 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP20293 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP20293 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms