Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ntf3P20181 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ntf3P20181 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms