Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NelfeP19426 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms