Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms