Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnnc1P19123 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms