Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18530 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18530 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18530 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18530 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms