Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18526 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18526 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18526 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18526 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18526 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18526 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18526 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18526 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18526 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms