Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pou4f1P17208 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms