Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmga1P17095 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms