Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd44P15379 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms