Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms