Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms