Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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DmdP11531 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DmdP11531 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DmdP11531 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DmdP11531 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
DmdP11531 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DmdP11531 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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DmdP11531 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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DmdP11531 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DmdP11531 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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DmdP11531 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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DmdP11531 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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DmdP11531 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DmdP11531 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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DmdP11531 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DmdP11531 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms