Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms