Protein–RNA interactions for Protein: P11033

Gzmd, Granzyme D, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmdP11033 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
GzmdP11033 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GzmdP11033 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
GzmdP11033 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms