Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prf1P10820 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms