Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms