Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms