Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb5P09079 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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