Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb7P09024 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms