Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NefmP08553 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefmP08553 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefmP08553 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefmP08553 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefmP08553 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefmP08553 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NefmP08553 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefmP08553 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefmP08553 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefmP08553 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NefmP08553 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NefmP08553 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NefmP08553 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NefmP08553 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NefmP08553 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NefmP08553 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NefmP08553 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NefmP08553 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NefmP08553 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NefmP08553 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NefmP08553 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NefmP08553 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NefmP08553 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NefmP08553 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefmP08553 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefmP08553 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NefmP08553 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NefmP08553 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NefmP08553 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NefmP08553 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NefmP08553 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms