Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna4P07351 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms