Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms