Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01810 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01810 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01810 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01810 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01810 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01810 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01810 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01810 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01810 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01810 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01810 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms