Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01654 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01654 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01654 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01654 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01654 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms